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Nombre del programa |
Distribuidor |
Plataforma de uso |
Funciones del
programa |
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ACD/ChemSketch |
Advanced Chemistry Development, Inc. |
Windows, Mac |
Es un paquete de dibujo que le permite dibujar estructuras
químicas, incluyendo los orgánicos, organometálicos, polímeros, y las
estructuras Markush. También incluye características tales como el cálculo de
propiedades moleculares (ejemplo, el peso molecular, densidad, etc refractividad
molar), limpieza de la estructura en 2D y 3D y la visualización, la
funcionalidad de las estructuras de nombres (menos de 50 átomos de anillos y 3),
y la predicción de logP . |
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| Acrobat Reader |
Adobe |
Windows, Mac, LINUX, AIX, SolarisOS, SolarisSun, Digital Unix |
Visualización de graficas |
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Avogadro |
GNU GPL |
Windows, MAC OSX, Linux |
es un editor y visualizador molécula de avanzada diseñado para
uso multi-plataforma en la química computacional, modelado molecular,
bioinformática, ciencias de los materiales, y áreas relacionadas. |
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BKChem |
GNU GPL |
Windows, MAc, Linux |
programa de química de dibujo. |
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Chimera |
UCSF |
Windows XP , vista, 7, 8, Mac OSX, Linux, SGI IRIS, HP TRU64 para 64 Linux,
windows7, Mac, linux |
Es un programa altamente extensible para la visualización
interactiva y el análisis de estructuras moleculares y los datos relacionados,
incluyendo mapas de densidad, secuencia de alineaciones, resultados de
acoplamiento, trayectorias, y conjuntos de conformación. Imágenes de alta
calidad y se pueden generar animaciones . |
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ChemSite |
chemistry-software |
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ChemSite es un programa de modelado molecular tridimensional para
dibujar, visualizar y simular el comportamiento dinámico de moléculas orgánicas
y biológicas. Dibuja en 2D, deja convertir chemsite en 3D. Exhibición como bola
y palillo, espacio llenando la esfera. Construir proteínas y ADN fácilmente. |
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Cn3D |
NCBI Structure |
Windows, Mac y unix |
es una aplicación de ayuda para su navegador web que le permite
ver en 3 dimensiones las estructuras de la base de datos NCBI. Cn3D muestra
simultáneamente la estructura, secuencia, y la alineación, y ahora cuenta con la
anotación de gran alcance y las características de alineación de edición. |
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enCIFer |
The Cambridge Crystallographic Data Centre |
Windows, Linux 32-bit y 64-bit, Mac
OS |
CIF, editicion y visualizacion de software del CCDC. |
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gOpenMol |
Leif Laaksonen, Finland |
Windows 95/98/Me/NT/2000/XP, GNU/Linux x86 |
Interfase gráfica para la serie de programas de química cuántica OpenMol
(los Autores ya no se responsabilisan por actualizaciones o errores del sistema) |
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Grasp |
Columbia University,
Donald Petry |
Windows |
Visualización y análisis moleculares. Util para
superficies electrostáticas |
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Ghemical-GMS |
Universuty of Iowa, Jan Jensen / Donald Curtis |
Mac, Unix, Windows |
software con algunas herramientas de visualización 3D agradable.
La optimización de la geometría (por MM y MC) y la dinámica molecular (por MM)
están incluidos algoritmos. Ghemical está escrito en C + +. |
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| HyperChem |
Hypercube, Inc. |
Windows,
Mac, ipad, iphone |
Visualización y manipulación de moléculas |
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Jmol |
GNU GPL |
Windows, Mac, Unix/Linux |
es un visor de Java de código abierto, para estructuras químicas en 3D |
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King |
Laboratory Richardson |
SGI, LINUX, MAC, Windows |
Interactivo para gráficos vectoriales tridimensionales. Soporta un conjunto de
gráficos primitivos que lo hacen adecuado para muchos tipos de gráficos, |
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Mage |
Laboratory Richardson |
SGI, LINUX, MAC, Windows |
es un programa vectorial de visualización en 3D que muestra "kinemage"
gráficos. Se utiliza tanto en la docencia y la investigación, en aplicaciones
que van desde la ecología del estuario de rayos X de las evaluaciones de calidad
de cristalografía de modelo, |
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MacMolPlt |
Brett Bode, |
Mac OS X, Linux y Windows |
Programa
moderno de gráficos para dibujar estructuras moleculares D-3 y los modos
normales |
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Mol2Mol |
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Windows |
Visualización de moléculas, convertidor de
formatos |
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| Molden |
CAOS/CAMM Center, The Netherlands |
UNIX |
Gráficas de densidades electrónicas |
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| Moldraw |
University of Torino Italia, Piero UGLIENGO |
MS Windows (Linux & Mac OS X) |
Visualización de moléculas y cristales |
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| MolPOV Ver.
2 |
Departament of Chemistry, Univeristy of Florida |
Windows |
Es un programa de Visualización con la capacidad de
convertir archivos de estructura atómica en formato Brookhaven databank
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MolWin V. 2.0 |
Institut für Chemie. Technische Universität, Chemnitz-Zwickau |
Windows |
Gráficas moleculares. Acepta coordenadas cartesianas, salida de Gaussian, PDB |
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MOPLOT |
University of Fribourg,
Rouslan V. Olkhov, Thomas Bally, |
Windows,Linux, Mac OS, |
Visualización de propiedades nodales y formas de
orbitales
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MovieMol |
Uppsala University, Sweden, Dr. Lars Ojamãe |
PC, IBM RS6000, SGI |
Programa de visualización y animación de
moléculas
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Octave |
John W. Eaton. |
windows,
Linux, BSD Systems,OS X |
Octave is normally used through its interactive command line interface, but it
can also be used to write non-interactive programs. The Octave language is quite
similar to Matlab so that most programs are easily portable. |
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| PovChem |
University of Illinois at
Urbana-Champaign Paul A.Thiessen |
Windows, Mac, Linux, SGI Irix |
Gráficas moleculares de alta calidad |
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| Psi88 |
Yale University |
Código fuente en fortran 77 |
Gráficas de densidades electrónicas |
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Pymol |
SCHRODINGUER |
Linux, Mac,Windows |
es un sistema por el usuario patrocina molecular
visualizador sobre una base de código abierto. Por favor, apoyen el
desarrollo de este software de código abierto, |
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| RasMol(OpenRasmol) |
Herbert J. Bernstein |
Linux, Mac, Windows |
Gráficas moleculares para la visualización de
proteínas, ácidos
nucléicos y moléculas pequeñas |
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| RasMol for
NextStep |
National Hellenic Research Foundation,
Greece |
NextStep 2.1 |
Gráficas moleculares para la visualización de
proteínas, ácidos nucléicos y moléculas pequeñas |
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| Raster3D |
University of Washington |
Código fuente con Makefiles para DEC, SGI, ESV,
SUNOS, IBM, HP, linux, Mac |
Gráficas moleculares para la visualización de
proteínas, ácidos nucléicos y moléculas pequeñas |
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Re_View |
Brunel University, Department of Chemistry,
UK |
Windows 3 |
Visor y analizador químico de 4D capaz de desplegado
3D, animación y análisis geométrico. Permite la manipulación de moléculas en 3D,
la animación de rutas de reacción u otros tipos de datos de etapas múltiples
(como datos conformacionales), y la animación de modos normales de vibración,
entre otros. |
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RPluto |
The Cambridge Crystallographic Data Centre |
Windows 2000/XP , Linux, RedHat Enterprise 3.0,4.0, SUSE 9.0, 9.1
Mandrake 9.2, 10, 10.2
Debian 3.1, Silicon Graphics R5000 and above, IRIX
Sun SPARC, Solaris 8, 9, 10, MacOSX 10.3, 10.4 |
Graphical Display of Molecular and Crystal Structures |
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Scilab |
Scilab Enterprises |
Linux, Windows XP, Vista, 7, 8,Mac Os-x |
Maths & Simulation, 2-D & 3-D Visualization, Optimization, Statistics, Control
System Design & Analysis, Signal Processing, Application Development |
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| SWISS-Pdb
Viewer
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Glaxo CH |
Mac, Windows |
Programa para visualizar estructuras del Protein
Data Bank
con POV |
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| SymApps(KnowItAll) |
bio-rad |
Windows |
Visualización tridimensional para impresión de presentaciones |
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Sybyl-X |
Certara |
Linux, pero es posible ver el trabajo de forma remota en Linux, Mac y Windows |
expert molecular modeling environment provides the fundamental components for
understanding molecular structure and properties with special focus on the
creation of new chemical entities. |
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Tessel |
Departamento de Química Física y Analítica, Universidad de Oviedo, España |
fortran 77 |
Tessel2 is a 3D "compiler" to produce crystal
and molecular models, parametric surfaces and several forms of sphere tesselations.
Molecular models combine balls-and-sticks, arrows and coordination polyhedra
representations of pure and defective crystals, finite molecules or clusters.
The Madelung potential of an ionic system can be computed and depicted on
an arbitrary plane or surface.
The program produces output to be rendered with POV-Ray, Geomview or any Virtual Reality renderer. |
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| ViewMol |
Ohio Supercomputing center |
Linux,
FreeBSD, Dec AlphaOSF1,IBMAIX,Windows Silicon graphics, SunOS |
Programa para la visualización de salidas de
programas de mecánica cuántica y mecánica molecular, como Gaussian 9x, Discover,
DMol/DSolid, Gulp, Turbomole, y archivos PDB. Visualiza geometrías, vibraciones,
trayectorias/optimizaciones con dinámica molecular, diagramas de niveles
energéticos de OM, orbitales moleculares, densidad electrónica. |
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| Visual Molecular Dynamics. VMD |
Theoretical Biophysics Group |
MacOs X, Unix, Windows |
Es un programa que diseña moléculas para su
visualización y análisis de sistemas biológicos como proteínas, ácidos
nucleicos, capas bilipídicas. |
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| WHAT IF |
The EMBL Sander Group |
Linux |
Modelado macromolecular: análisis de estructura
protéica que puede ser usado para predecir mutaciones, verificación de
estructura, gráficas moleculares, etc. |
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XDrawChem |
GNU GPL |
Linux, SGI IRIXSun Solaris, Mac, Windows |
programa molécula de dibujo en dos dimensiones |
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